Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms