Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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