Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms