Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Cldn23Q9D7D7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Cldn23Q9D7D7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Cldn23Q9D7D7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Cldn23Q9D7D7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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