Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Q9D4W2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Q9D4W2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Q9D4W2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D4W2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms