Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms