Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 353.7 ms