Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Snx29Q9D3S3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Snx29Q9D3S3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx29Q9D3S3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx29Q9D3S3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx29Q9D3S3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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