Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms