Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chchd2Q9D1L0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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