Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ube2cQ9D1C1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms