Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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