Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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