Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.2 ms