Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ndufb9Q9CQJ8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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