Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms