Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nudcd2Q9CQ48 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms