Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Chmp3Q9CQ10 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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