Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms