Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cep41Q99NF3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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