Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gdpd3Q99LY2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gdpd3Q99LY2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gdpd3Q99LY2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms