Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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