Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ciao1Q99KN2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms