Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlgn1Q99K10 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms