Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms