Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms