Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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CsprsQ99388 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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CsprsQ99388 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CsprsQ99388 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms