Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Slc8b1Q925Q3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Slc8b1Q925Q3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Slc8b1Q925Q3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Slc8b1Q925Q3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc8b1Q925Q3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms