Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms