Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms