Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms