Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms