Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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