Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Card11Q8CIS0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Card11Q8CIS0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Card11Q8CIS0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Card11Q8CIS0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Card11Q8CIS0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Card11Q8CIS0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Card11Q8CIS0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Card11Q8CIS0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Card11Q8CIS0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Card11Q8CIS0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms