Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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