Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms