Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc21aQ8C0S4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms