Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tnfsfm13Q8BXS2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tnfsfm13Q8BXS2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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