Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms