Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms