Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf41Q8BH75 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf41Q8BH75 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms