Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ubash3bQ8BGG7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ubash3bQ8BGG7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ubash3bQ8BGG7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ubash3bQ8BGG7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ubash3bQ8BGG7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ubash3bQ8BGG7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ubash3bQ8BGG7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ubash3bQ8BGG7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ubash3bQ8BGG7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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