Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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