Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms