Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AknaQ80VW7 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms