Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Dsg1bQ7TSF1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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