Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms