Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms