Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms