Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.8 ms